非小细胞肺癌顺铂耐药相关基因生物信息学研究

目的：通过分析非小细胞肺癌顺铂敏感株及耐药株的基因芯片表达数据，筛选差异基因及关键通路，构建蛋白相互作用网络，探讨关键集群功能。方法:从GEO数据库获得基因芯片表达数据，利用GEO2R工具筛选差异基因，通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络，经DAVID富集得到相关特征基因与信号通路信息。结果：通过芯片分析共获得481个差异表达基因，相比于敏感细胞株，顺铂获得性耐药细胞株中有418个上调基因和63个下调基因。差异基因功能主要富集在piRNA代谢、DNA甲基化修饰、细胞有丝分裂及细胞周期进程等信号通路。蛋白复合物预测得到主要功能集群6个，分别与细胞趋化性、细胞角化性、piRNA代谢过程、细胞因子受体相互作用、细胞因子分泌调节及染色质沉默相关生物进程相关。结论:本研究利用生物信息学方法，发现顺铂耐药细胞株特征基因及信号通路，其中SAA1、KRT5、TDRD9、BCL2A1、CSF1R和HIST1H1A等显著上调基因及其功能集团可能是非小细胞肺癌顺铂耐药的潜在分子机制，为临床精准治疗提供新的理论依据。     

3 404例2型糖尿病患者视网膜病变患病率及其相关因素分析

目的 分析2型糖尿病（T2DM）患者视网膜病变（DR）患病率及其相关因素。方法 对3 404例2型糖尿病住院患者进行回顾性研究，根据眼科会诊结果，将患者分为3组，其中非DR组（A组/NDR组）2 562例，DR非增殖期组（B组/NPDR组）716例，DR增殖期组（C组/PDR组）126例。得出DR的患病率，比较3组患者之间临床资料及临床指标的异同，及其与DR的相关性。结果 2型糖尿病患者DR患病率达24.7%，与甘油三酯（OR=1.110，P=0.000）、糖化血红蛋白（HbA1c）（OR=1.087，P=0.000）、血尿酸（OR=1.003，P=0.000）、病程（OR=1.002，P=0.000）相关。结论 2型糖尿病患者DR患病率为24.7%，高血脂、高血糖、高尿酸血症、病程长为DR的独立危险因素。早期发现糖尿病、早期治疗糖尿病、积极控制血糖血脂血尿酸，对于减少DR的发生及延缓DR的发展意义重大。     

四妙勇安汤方源探析

四妙勇安汤由金银花、玄参、当归、甘草4味药物组成,为《古代经典名方目录(第一批)》中100个经典名方之一。经溯源发现,四妙勇安汤源于《石室秘录》,后由《古今图书集成·医部全录》《验方新编》等书引用。从古代文献记载来看均有方无名,"四妙勇安汤"之名,最早见于1956年《中医治疗动脉栓塞性坏疽症的成效》,是由当时记者吕民报道河北省释迦宝山用"四妙勇安汤"治疗当地的动脉栓塞性坏疽时冠名。四妙勇安汤从方药组成与剂量上看,从《石室秘录》开始即是"金银花三两,当归二两,生甘草一两,玄参三两",历代版本《方剂学》确定四妙勇安汤金银花、玄参、当归、甘草的比例就是3∶3∶2∶1。而查阅文献,释迦宝山临证所用的四妙勇安汤由"玄参132 g,当归99 g,银花66 g,甘草33 g"组成,金银花、玄参、当归、甘草的比例变成2∶4∶3∶1。从治疗时间上看,原方记载的7日愈或是10日愈,而释迦宝山将其用到了三四个月,甚至五六个月。研究认为,古籍中的四妙勇安汤,应该是用于疾病的初期,尽早发现和治疗;而释迦宝山修改过的剂量,是广泛用于脱骨疽的中后期,甚至出现坏疽的严重病情所使用的,因此服药时间长,剂量大。且四妙勇安汤临证不仅限于治疗脱骨疽,也用于大头疮等,现代该方的使用已经大为拓展。相关研究已证实四妙勇安汤具有抗炎、稳定斑块、降脂、保护血管、改善血液流变学、抗凝、抑制血栓形成和促纤溶等作用,后续应开展君臣佐使辨析,对其临床应用范围重新进行界定。     

体质指数与糖尿病交互作用对肛周脓肿术后复发的影响

目的:探讨体质指数与糖尿病交互作用对肛周脓肿术后复发的影响。方法:选取2015年1月至2016年3月贵州中医药大学第一附属医院收治的肛周脓肿住院患者790例的临床资料作为研究对象,进行回顾性分析,通过Cox比例风险模型及似然比检验分析体质量指数(BMI)和糖尿病对术后复发的交互作用。结果:合并有糖尿病的脓肿患者,每增加1个1 kg/m~2的BMI,将会增加28%的术后脓肿复发的风险(HR=1.28,95%CI 1.05,1.56,P交互=0.03)。结论:脓肿术后复发风险在患有糖尿病且BMI高的人群中较高,从而有助于早期识别高危患者,改善预后。     

Reflection of neuroblastoma intratumor heterogeneity in the new OHC-NB1 disease model

Accurate modeling of intratumor heterogeneity presents a bottleneck against drug testing. Flexibility in a preclinical platform is also desirable to support assessment of different endpoints. We established the model system, OHC-NB1, from a bone marrow metastasis from a patient diagnosed with MYCN-amplified neuroblastoma and performed whole-exome sequencing on the source metastasis and the different models and passages during model development (monolayer cell line, 3D spheroid culture and subcutaneous xenograft tumors propagated in mice). OHC-NB1 harbors a MYCN amplification in double minutes, 1p deletion, 17q gain and diploid karyotype, which persisted in all models. A total of 80–540 single-nucleotide variants (SNVs) was detected in each sample, and comparisons between the source metastasis and models identified 34 of 80 somatic SNVs to be propagated in the models. Clonal reconstruction using the combined copy number and SNV data revealed marked clonal heterogeneity in the originating metastasis, with four clones being reflected in the model systems. The set of OHC-NB1 models represents 43% of somatic SNVs and 23% of the cellularity in the originating metastasis with varying clonal compositions, indicating that heterogeneity is partially preserved in our model system.     

曲美他嗪对冠心病合并左心功能不全的效果

目的 探讨冠心病合并左心功能不全患者行曲美他嗪治疗的临床效果.方法 选择医院于2016年3月—2017年4月期间接收的老年冠心病合并左心功能不全患者60例,采用随机数字表法形式均分为研究组和对照组,每组均30例.对照组行基础治疗,研究组在此基础上口服曲美他嗪,记录两组心功能指标以及不良反应发生率.结果 研究组治疗后LVEDD、LVESD指标低于对照组,左心室射血分数高于对照组(P<0.05);研究组和对照组在用药过程中均未出现严重的反应,研究组出现3例转氨酶上升,2例胃肠道不适;对照组出现2例转氨酶上升,组间对比P<0.05.结论 曲美他嗪行冠心病合并左心功能不全治疗效果明显,心肌功能以及血脂水平有所改善.     

案例分析与情景模拟在急诊护理教学的效果

目的探讨分案例分析法结合情景模拟法在急诊护理学生教学中的应用价值。方法以2016年10月-2017年10月本院纳入的46例急诊科实习护士为例展开研究,以教学方式的不同将46例急诊科实习护士分成观察组(n=23,接受案例分析法结合情景模拟法教学)和对照组(n=23,接受传统法教学),教学结束后对比分析两组急诊科实习护士的学习情况以及评判性思维能力。结果教学结束后,经考核发现,观察组实操成绩以及理论成绩均高于对照组(P <0.05);观察组寻求真相、求知欲、系统化能力以及分析能力等评判性思维能力均高于对照组(P <0.05)。结论在急诊护理学生教学中应用案例分析法结合情景模拟法进行教学,有利于急诊科实习护士掌握理论知识以及实操知识,同时还可以提高其评判性思维能力,可实现有效教学。     

地黄毛蕊花糖苷合酶基因的克隆、亚细胞定位与表达特性分析

目的克隆地黄Rehmanniaglutinosa毛蕊花糖苷合酶基因(Rg Ac S1),分析其亚细胞定位和表达模式。方法在地黄的转录组数据库中通过注释和比对,获得地黄Rg Ac S1的c DNA序列,利用聚合酶链式反应(PCR)方法进行分子克隆。构建绿色荧光蛋白(GFP)融合表达载体,以农杆菌瞬时表达法观测Rg Ac S1的亚细胞定位。利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测Rg Ac S1基因在地黄块根不同部位的表达模式。结果获得地黄1个莽草酸-O-羟基肉桂酰基转移酶的全长编码序列,c DNA长度为1 659 bp,包含1个1 296 bp的开放阅读框,编码431个氨基酸残基,蛋白质相对分子质量为475 900,具有莽草酸-O-羟基肉桂酰基转移酶的典型结构域,命名为Rg Ac S1。亚细胞定位结果显示Rg Ac S1主要分布在细胞质中,在细胞核中也有分布。q RT-PCR分析表明,Rg Ac S1在地黄的周皮和根毛中表达量较高,在木质部和韧皮部表达量较低。Rg Ac S1基因在地黄品种北京1号、QH1和85-5中非菊花心中表达量均高于菊花心中的表达量,且差异达极显著水平。结论获得地黄Rg Ac S1的c DNA序列,明确了Rg Ac S1的亚细胞定位和时空表达模式,为进一步研究Rg Ac S1基因在毛蕊花糖苷合成过程中的作用奠定基础。     

中药火麻仁基原植物大麻的TIFY基因家族鉴定及功能分析

目的:从全基因组层面对大麻(Cannabis sativa)TIFY基因家族进行鉴定与功能分析,为解析大麻TIFY家族基因功能及其对大麻素等次生代谢产物生物合成的调控机理奠定基础。方法:采用已有大麻基因组数据,通过NCBI,PlantTFDB,MEME及TBtools等生物信息学分析工具,鉴定大麻中的TIFY家族基因,并对其编码蛋白的理化性质、系统进化、基因结构、染色体定位及组织差异表达模式等进行分析和可视化作图。结果:该研究共鉴定到大麻TIFY家族基因成员14个(CsTIFY1～CsTIFY14),分属于TIFY,JAZ,ZML和PPD共4个亚家族,其核酸序列长度为365～1 369 bp,编码氨基酸长度为118～442 aa,等电点为4.64～9.96。14个CsTIFYs不均匀的分布在8条染色体上,亚细胞定位预测其蛋白均定位细胞核中。CsTIFYs基因的启动子区具有多种非生物胁迫响应的顺式作用元件,可参与植物的不同生长发育和非生物胁迫调控。转录组表达热图分析表明,CsTIFYs在不同大麻品种的雌花及同一品种的花、苞片、茎、叶中均存在表达差异。结论:该研究从全基因组水平鉴定到大麻CsTIFY家族转录因子14个,并对其结构特点和表达模式进行研究,预测大麻CsTIFYs可能在大麻的JA信号转导通路、非生物胁迫及大麻素生物合成中发挥重要调控作用,将对大麻中TIFY家族的基因功能研究以及大麻优质品种选育提供科学参考。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨生脉注射液抗新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的采用网络药理学与分子对接技术探讨生脉注射液的活性成分和治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在作用机制。方法利用TCMSP及BATMAN-TCM数据库筛选生脉注射液的活性化合物,通过TCMSP及Targetnet在线数据库预测作用靶点,通过Cytoscape3.7.1构建活性成分-作用靶点网络图;在GeneCards及OMIM数据库中以"coronavirus pneumonia"为关键词搜索冠状病毒肺炎相关疾病靶点,与生脉注射液化合物靶点进行交集筛选出共同靶点作为研究靶点,将共同靶点导入STRING数据库获取数据后在Cytoscape 3.7.1软件中构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用R语言进行GO(gene ontology)功能、KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,预测其作用机制,并构建"成分-靶点-通路"网络图;通过DiscoveryStudio 2.5软件对关键靶点进行分子对接分析。结果生脉注射液筛选得到22个活性化合物,分别为邻苯二甲酸二辛酯、β-谷甾醇、当归酰基戈米辛O、戈米辛A、戈米辛R、五味子丙素、内南五味子酯乙、长南酸、南五味子内酯、香蒲木脂素B、新杜松烷酸A、新杜松烷酸B、新杜松烷酸C、新南五味子木脂宁、五味子内酯A、五味子内酯E、五味子酸、尿苷、薯蓣皂苷元、鸟嘌呤核苷、N-反式阿魏酰酪胺、豆甾醇。相应作用靶点224个,与COVID-19的共同靶点16个,分别为CASP3、CASP8、PTGS2、BCL2、BAX、PRKCA、PTGS1、PIK3CG、F10、NOS3、DPP4、NOS2、TLR9、ACE、ICAM1、PRKCE,关键靶点涉及CASP3、PTGS2、NOS2、NOS3、ICAM1。GO功能富集分析得到生物过程(BP)条目771个,细胞组成(CC)条目11个,分子功能(MF)条目79个。KEGG通路富集分析筛选得到67条(P0.05)信号通路,主要涉及糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、凋亡通路、P53信号通路、小细胞肺癌通路等。分子对接结果显示与关键靶点对接较好的成分有五味子内酯E、豆甾醇、N-反式阿魏酰酪胺。结论生脉注射液中的活性化合物五味子内酯E、豆甾醇、N-反式阿魏酰酪胺等能作用于CASP3、PTGS2、NOS2、NOS3等靶点调节多条信号通路发挥抗炎、免疫调节、抗休克、增加血氧饱和度等作用,从而可能发挥对COVID-19的治疗作用。